立志成为出色的神奇宝贝训练师,小智、小遥和小胜,带着皮卡丘展开了新旅程。为了观看千年彗星出现的刹那,来到恩斯游乐场,认识魔术师巴特勒与黛安。在魔术表演中,小胜听到一阵细微的呼唤声…那是在“沉眠之茧”中沉睡了千年,可帮助人们达成愿望的神奇宝贝─基拉祈。在千年彗星出现的夜晚,如果遇上了拥有纯真心灵的伙伴便会苏醒。为了让基拉祈醒来,巴特勒请小胜当基拉祈的伙伴,果然,基拉祈从万花镜般的光芒中苏醒过来。虽然基拉祈只能停留短暂的7日后便会消失,但是还没有属于自己的神奇宝贝的小胜,对基拉祈却非常宠爱。充满野心的魔术师巴特勒,因为知道基拉祈拥有神奇的力量,便把基拉祈给抢走,并且想利用他来完成愿望,不怀好意的巴...